נעשה תחת הרדמה מקומית (בניגוד לניתוח) כך שיש קשר רציף עם המטופל, ללא צלקת בצוואר לצמיתות, ניתן לעצור בכל רגע את הפעולה ולבדוק את המטופל במקרה ועולה חשד לשבץ מוחי.
יתרון נוסף – גם במידה ומתרחש שבץ מוחי על השולחן – ניתן מיידית לאתר את מקום החסימה, לעבור להרדמה כללית ולטפל בה. בניתוח, אבחון שבץ מתרחש בד"כ רק לאחר שמעירים את המטופל – בד"כ לפחות שעה מתום הניתוח. צנתור ניתן להציע למטופלים שנותחו בעבר בעורק המוצר ומדובר בהצרות חוזרת, במטופלים לאחר הקרנות לצוואר, ולאלו עם אנטומיה מאתגרת מבחינת הכירורג.
יחד עם זאת, אין לשכוח שהניסיון העולמי בניתוח הינו עתיר-שנים (מעל 40 שנה) לעומת צנתור, שבו רק בעשור האחרון החלו להצטבר דיווחים התומכים בבטיחות גבוהה , בדומה לניתוח. כל זאת הודות לתומכנים חדשים שנכנסו לשימוש והשיפור הדרמטי ברמת המיומנות הטכנית של מצנתרי המוח בעולם בעקבות הגידול הדרמטי בטיפולים בשבץ, במפרצות ובשאר מחלות כלי דם מוחיים.